1. Trang chủ
  2. » Giáo Dục - Đào Tạo

Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa

51 22 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Nghiên Cứu Thiết Kế Tạo Dòng Và Biểu Hiện Protein Tái Tổ Hợp OsmC2 Từ Vi Khuẩn Cổ Thermococcus Kodakarensis KOD1 Để Đánh Giá Khả Năng Bảo Vệ Tế Bào Khỏi Gốc Oxy Hóa
Tác giả Lê Ngọc Ánh
Người hướng dẫn TS. Phạm Bằng Phương
Trường học Đại Học Thái Nguyên
Chuyên ngành Công Nghệ Sinh Học
Thể loại khóa luận tốt nghiệp
Năm xuất bản 2021
Thành phố Thái Nguyên
Định dạng
Số trang 51
Dung lượng 1,71 MB

Nội dung

Ngày đăng: 06/05/2022, 19:22

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. Nguyễn Văn Cách, (2005) Giáo trình tin sinh, Nhà xuất bản Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Giáo trình tin sinh
2. Nguyễn Hoàng Lộc, Triệu Thị Lệ, Hà Thị Minh,(2007) Giáo trình sinh học phân tử, nhà xuất bản khoa học và kỹ thuật Sách, tạp chí
Tiêu đề: Giáo trình sinh học phân tử
3. Hồ Thị Tuyết Mai, Bài giảng Công nghệ Enzyme, (2006) Trường CĐ Lương Thực Thực Phẩm Đà Nẵng Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bài giảng Công nghệ Enzyme
4. Trần Xuân Ngạch, Công Nghệ Enzyme, (2007) Nhà xuất bản Đại Học Bách Khoa Đà Nẵng Sách, tạp chí
Tiêu đề: Công Nghệ Enzyme
6. Pham, B.P, Jia, B, Lee, S, Ying, S, Kwak, J.M, Cheong, G.-W, Chaperone-like activity of a bacterioferritin comigratory protein from Thermococcus kodakaraensis KOD1 (2015), Protein and Peptide Letters 22 (5), Pages 443-448 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Thermococcus kodakaraensis "KOD1" (2015), Protein and Peptide Letters 22 (5)
Tác giả: Pham, B.P, Jia, B, Lee, S, Ying, S, Kwak, J.M, Cheong, G.-W, Chaperone-like activity of a bacterioferritin comigratory protein from Thermococcus kodakaraensis KOD1
Năm: 2015
7. Cui, Z., Wang, Y., Pham, B.P., Ping, F., Pan, H., Cheong, G.-W., Zhang, S., Jia, B. High level expression and characterization of a thermostable lysophospholipase from Thermococcus kodakarensis KOD1 (2012) Extremophiles, 16 (4), pp. 619-625 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Thermococcus kodakarensis" KOD1 (2012) "Extremophiles
8. C. Schiraldi, M. Giuliano, M. De Rosa, Perspectives on biotechnological applications of archaea, Archaea 1 (2002), tr 75–86 Sách, tạp chí
Tiêu đề: biotechnological applications of archaea, Archaea 1
Tác giả: C. Schiraldi, M. Giuliano, M. De Rosa, Perspectives on biotechnological applications of archaea, Archaea 1
Năm: 2002
9. C. Gutierrez, J.C. Devedjian, “Osmotic induction of gene osmC expression in Escherichia coli K12”, J. Mol. Biol. 20 (1991) 959–973 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Osmotic induction of gene osmC expression in Escherichia coli K12”", J. Mol
10. U. Vửlker, K.K. Andersen, H. Antelmann, K.M. Devine, M. Hecker, “One of two OsmC homologs in Bacillus subtilis is part of the σB-dependent general stress regulon”, J. Bacteriol. 180 (1998) 4212–4218 Sách, tạp chí
Tiêu đề: One of two OsmC homologs in Bacillus subtilis is part of the σB-dependent general stress regulon”", J. Bacteriol
11. Atomi, H., et al., “Description of Thermococcus kodakaraensis sp. nov., a well studied hyperthermophilic archaeon previously reported as Pyrococcus sp.KOD1”. Archaea, 2004. 1(4): p. 263-7 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Description of "Thermococcus kodakaraensis" sp. nov., a well studied hyperthermophilic archaeon previously reported as Pyrococcus sp. KOD1”". Archaea, 2004
12. Fukui, T., et al (2011), “Complete genome sequence of the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis KOD1 and comparison with Pyrococcus genomes”. Genome Res115(3): p. 352-63 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Complete genome sequence of the hyperthermophilic archaeon" Thermococcus kodakaraensis " KOD1 and comparison with" Pyrococcus "genomes”". Genome Res1
Tác giả: Fukui, T., et al
Năm: 2011
13. Jia, B., Lee, S., Pham, B.P., Kwack, J.M., Jin, H., Li, J., Wang, Y., Cheong, G.- W. “Biochemical characterization of deblocking aminopeptidases from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis KOD1”, Bioscience, Biotechnology and Biochemistry, 75 (6), pp. 1160-1166 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Biochemical characterization of deblocking aminopeptidases from the hyperthermophilic archaeon "Thermococcus kodakarensis "KOD1”, "Bioscience, Biotechnology and Biochemistry
14. Ruan, J., “Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (second edition) Volume 5 and the study of Actinomycetes systematic in China”. Wei Sheng Wu Xue Bao, 53(6): p. 521-30 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (second edition) Volume 5 and the study of Actinomycetes systematic in China”". Wei Sheng Wu Xue Bao
15. Macalady, J.L., et al.(2004), “Tetraether-linked membrane monolayers in Ferroplasma spp: a key to survival in acid. Extremophiles,. 8(5): p. 411-9 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Tetraether-linked membrane monolayers in Ferroplasma spp: a key to survival in acid". Extremophiles
Tác giả: Macalady, J.L., et al
Năm: 2004
16. Fiala, J., “The Scientific Council of the Czech Ministry of Health and its function”. Cesk Pediatr, 1986. 41(7): p. 418-9 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The Scientific Council of the Czech Ministry of Health and its function”." Cesk Pediatr
17. Li, J.F., “ A fast neighbor joining method. Genet Mol Res”, 2015. 14(3): p. 8733-43 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Li, J.F., “ A fast neighbor joining method. Genet Mol Res
18. Escriva, H., et al.(1995), “Rat mammary-gland transferrin: nucleotide sequence, phylogenetic analysis and glycan structure”. Biochem J, 307 (Pt 1): p. 47-55 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Escriva, H., et al.(1995), “Rat mammary-gland transferrin: nucleotide sequence, phylogenetic analysis and glycan structure
Tác giả: Escriva, H., et al
Năm: 1995
19. Miroshnichenko, V.P., et al.(1989), “Characteristics of the diagnosis and treatment of severe forms of late pregnancy toxemia”. Akush Ginekol (Mosk), (5): p. 43-8 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Miroshnichenko, V.P., et al.(1989), “Characteristics of the diagnosis and treatment of severe forms of late pregnancy toxemia
Tác giả: Miroshnichenko, V.P., et al
Năm: 1989
20. Zheng, X., et al.(2014), “Phylogeny and evolutionary histories of Pyrus L. revealed by phylogenetic trees and networks based on data from multiple DNA sequences”. Mol Phylogenet Evol, 80: p. 54-65 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Zheng, X., et al.(2014), "“Phylogeny and evolutionary histories of Pyrus L. revealed by phylogenetic trees and networks based on data from multiple DNA sequences”
Tác giả: Zheng, X., et al
Năm: 2014
21. Ishino, Y. and I.K. Cann(1998), “The euryarchaeotes, a subdomain of Archaea, survive on a single DNA polymerase: fact or farce”, Genes Genet Syst, 73(6): p.323-36 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ishino, Y. and I.K. Cann(1998), "“The euryarchaeotes, a subdomain of Archaea, survive on a single DNA polymerase: fact or farce”", Genes Genet Syst, 73(6): p
Tác giả: Ishino, Y. and I.K. Cann
Năm: 1998

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 2.1. Nơi phân lập - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Hình 2.1. Nơi phân lập (Trang 12)
Hình 2.2 Vi khuẩn chịu nhiệt Thermococcus kodakarensis KOD1 - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Hình 2.2 Vi khuẩn chịu nhiệt Thermococcus kodakarensis KOD1 (Trang 13)
Hình 2.3. Cây phân loại nhóm vi khuẩn Thermococcus - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Hình 2.3. Cây phân loại nhóm vi khuẩn Thermococcus (Trang 14)
Hình 2.4. Sơ đồ giải trình tự gen của vi khuẩn Thermococus kodakarensis KDO1 Chú thích: - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Hình 2.4. Sơ đồ giải trình tự gen của vi khuẩn Thermococus kodakarensis KDO1 Chú thích: (Trang 17)
Hình 2.5. Cơ chế kiểm soát sự phiên mã của T7 promoter [51] - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Hình 2.5. Cơ chế kiểm soát sự phiên mã của T7 promoter [51] (Trang 22)
Bảng 3.1. Hóa chất sử dụng trong đề tài - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Bảng 3.1. Hóa chất sử dụng trong đề tài (Trang 27)
Bảng 3.2. Thiết bị nghiên cứu STT Tên thiết bị Nguồn gốc xuất sứ - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Bảng 3.2. Thiết bị nghiên cứu STT Tên thiết bị Nguồn gốc xuất sứ (Trang 28)
Bảng 3.3. Thành phần phản ứng PCR khuếch đại gen OsmC2 - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Bảng 3.3. Thành phần phản ứng PCR khuếch đại gen OsmC2 (Trang 30)
Hình 3.1. Chu kì nhiệt nhân gen OsmC2 - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Hình 3.1. Chu kì nhiệt nhân gen OsmC2 (Trang 30)
Bảng 3.4. Thành phần phản ứng gắn gen vào vector tách dòng - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Bảng 3.4. Thành phần phản ứng gắn gen vào vector tách dòng (Trang 31)
Bảng 3.5. Thành phần phản ứng cắt plasmid bằng NdeI và XhoI - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Bảng 3.5. Thành phần phản ứng cắt plasmid bằng NdeI và XhoI (Trang 33)
Bảng 4.1. Kết quả đo độ tinh sạch và nồng độ ADN - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
Bảng 4.1. Kết quả đo độ tinh sạch và nồng độ ADN (Trang 38)
Hình 4.8 cho thấy, sau khi cắt kiểm tra với 2 enzyme giới hạn, các plasmid nghi ngờ mang gen đều cho 2 băng ở đúng với kích thước lý thuyết tương ứng với - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
nh 4.8 cho thấy, sau khi cắt kiểm tra với 2 enzyme giới hạn, các plasmid nghi ngờ mang gen đều cho 2 băng ở đúng với kích thước lý thuyết tương ứng với (Trang 44)
Hình ảnh 4.10. Tinh sạch protein OsmC2 bằng cột sắc kí Ni-NTA - Nghiên cứu thiết kế tạo dòng và biểu hiện protein tái tổ hợp osmc2 từ vi khuẩn cổ thermococcus kodakarensis KOD1 để đánh giá khả năng bảo vệ tế bào khỏi gốc oxy hóa
nh ảnh 4.10. Tinh sạch protein OsmC2 bằng cột sắc kí Ni-NTA (Trang 45)

TRÍCH ĐOẠN

Phương pháp tách chiết plasmid

Tinh sạch protein chịu nhiệt OsmC2

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w