CHỈ THỊ PHÂN TỬ Lê Quang Hòa Viện Công nghệ Sinh học & Công nghệ Thực phẩm Đại học Bách Khoa Hà Nội Định nghĩa • Trình tự DNA đặc trưng cho một cá thể Phân loại chỉ thị • Chỉ thị hình thái: Kiểu hình • Chỉ thị sinh hóa: Protein • Chỉ thị phân tử: Trình tự DNA Chỉ thị hình thái • Ví dụ: màu sắc, kích thước, hàm lượng…. • Rẻ, dễ thực hiện nhưng chịu sự ảnh hưởng của môi trường Chỉ thị sinh hóa = Isozyme • Định nghĩa: Các dạng khác nhau của một enzym • Allozyme: một enzym và một locus (một điểm định vị trên nhiễm sắc thể) • Isozyme: một enzym và nhiều locus (lặp gen, gia đình gen) • Điều kiện: có thể được phân tách bằng điện di và phát hiện được trên gel. Chỉ thị sinh hóa = Phương pháp • Nghiền và chiết protein từ mô thích hợp bằng đệm • Phân tách các protein trong dịch chiết bằng gel tinh bột hay gel polyacrylamit (không biến tính) • Hiển thị enzym bằng cách ngâm gel trong dung dịch cơ chất để enzym xúc tác tạo ra sản phẩm có màu Dụng cụ cần thiết Protein dự trữ trong hạt – Tại sao? • Protein dự trữ trong hạt có hàm lượng lớn và bền • Giai đoạn phát triển xác định • Dễ bảo quản và vận chuyển • Mỗi một vạch protein được coi như là sản phẩm của một gen. Định danh giống bằng chỉ thị sinh hóa Chỉ thị sinh hóa - Hạn chế • Hạn chế về số lượng: các enzym có thể phát hiện được trên gel • Các enzym đa cấu tử ⇒ kết quả phức tạp • Kết quả phụ thuộc vào môi trường và mô nghiên cứu. [...]...Chỉ thị phân tử • Số lượng: không hạn chế • Không phụ thuộc vào môi trường • Không phụ thuộc vào mô Phân loại chỉ thị phân tử • Bản chất : so sánh kích thước của các sản phẩm cắt DNA thể gen bằng enzym hạn chế trên gel • Các bước tiến hành: -Tách và tinh sạch DNA - Phân cắt bằng một hay nhiều enzym hạn chế - Điện di trên gel agarose để phân tách các sản phẩm của quá trình... trèn C: D: E: F: + RFLP- Các điểm cần chú ý • DNA chất lượng tốt: tinh sạch, không bị đứt gãy • Tìm đoạn dò đa hình ⇒ giá thành đắt • Quy trình phân tích dài so với các chỉ thị PCR • Sử dụng phóng xạ ⇒ hạn chế phạm vi sử dụng • Cần lượng lớn DNA Các loại chỉ thị PCR • Không cần thiết DNA chất lượng tốt • Rất nhạy ⇒ dễ nhiễm • Phản ứng PCR cần phải được tối ưu hóa • Nhanh • Giá thành rẻ Dùng một mồi . cho một cá thể Phân loại chỉ thị • Chỉ thị hình thái: Kiểu hình • Chỉ thị sinh hóa: Protein • Chỉ thị phân tử: Trình tự DNA Chỉ thị hình thái • . nghiên cứu. Chỉ thị phân tử • Số lượng: không hạn chế • Không phụ thuộc vào môi trường • Không phụ thuộc vào mô Phân loại chỉ thị phân tử • Bản