Sản xuất nông nghiệp ngày nay dần trở thành tiêu ựiểm quan tâm không những trên phạm vi quốc gia mà còn trên phạm vi toàn cầụ Sản xuất nông nghiệp Việt Nam ựóng góp 24% GDP, 30% sản lượng xuất khẩu, tạo việc làm cho 60% lao ựộng cả nước xong sản xuất nông nghiệp lâu nay vẫn chưa chú trọng ựúng mức tới việc bảo vệ môi trường. Sản xuất nông nghiệp sạch, nâng cao chất lượng nông sản nhằm bảo ựảm vệ sinh an toàn thực phẩm và thân thiện với môi trường ựang là mục tiêu phấn ựấu của nền nông nghiệp nói chung và nông dân nói riêng. Một trong những biện pháp hữu hiệu ựể sản xuất nông nghiệp sạch là ứng dụng rộng rãi các chế phẩm sinh học, sử dụng phân hữu cơ vi sinh nhằm thay thế các hóa chất bảo vệ thực vật và các loại phân hóa học có tác ựộng xấu ựến môi trường.
Trong những năm qua, sản xuất nông nghiệp của Việt Nam có nhiều tiến bộ vượt trội và ựóng góp cho sự phát triển kinh tế xã hộị Trong tương lai, nước ta ựịnh hướng phát triển thành các vùng chuyên canh hàng hóạ Việc thâm canh cây trồng mang lại hiệu quả kinh tế cao, xong bên cạnh ựó cũng gây ra nhiều bất lợi ựối với môi trường và sự phát triển bền vững. Trong khi ựó, nguồn phế phụ phẩm nông nghiệp thải ra trong quá trình sản xuất nông nghiệp và chế biến nông sản của Việt Nam ước tắnh trên 50 triệu tấn mỗi năm. Nguồn phế thải trong chăn nuôi gia súc gia cầm lên ựến hàng triệu tấn.
Lượng phế thải này phần lớn là những hợp chất hữu cơ giàu cacbon và các nguyên tố khoáng ựa vi lượng. đây là nguồn nguyên liệu có giá trị lý tưởng cho sản xuất các dạng chế phẩm sinh học cũng như phân hữu cơ sinh học chất lượng cao phục vụ nông nghiệp. Tuy nhiên nguồn phân hữu cơ này nếu không ựược khai thác sẽ là nguồn gây mô nhiễm môi trường rất lớn.
Nông nghiệp sạch, dựa trên các kiến thức khoa học kết hợp với sự màu mỡ của ựất ựai và các biện pháp cải tạo ựất nhằm ựảm bảo chất lượng sản phẩm và việc sử dụng ựất lâu dài, bên cạnh ựó, vai trò quan trọng ựặc biệt của chất hữu cơ ựối với ựộ phì nhiêu của ựất ựã ựược thừa nhận một cách rộng rãị Chất hữu cơ góp phần cải tạo ựặc tắnh vật lý, hóa học cũng như sinh học ựất và cung cấp nhiều dưỡng chất quan trọng cho cây trồng. Việc cung cấp các nguyên tố vi lượng, các dưỡng chất từ phân hữu cơ có ý nghĩa trong việc gia tăng phẩm chất nông sản, làm trái cây ngon ngọt và ắt sâu bệnh hơn. Bón phân hữu cơ còn là nguồn cung cấp dinh dưỡng cần thiết cho hoạt ựộng của vi sinh vật ựất: các quá trình chuyển hóa, tuần hoàn dinh dưỡng trong ựất, sự cố ựịnh ựạm, sự nitrat hóa, sự phân hủy tồn dư thuốc bảo vệ thực vật cũng như ức chế sự hoạt ựộng của các loại vi sinh vật gây bất lợi cho cây trồng.