IV/ NHỮNG NGUYÊN NHÂN TỒN TẠI 1/ Công tác quản lý và tổ chức
2. Việc lãnh đạo, phối hợp của các ngành và chính quyền địa phương
Trong thời gian thực hiện Luật doanh nghiệp cho thấy thủ tục thành lập doanh nghiệp đơn giản, tuy đã tạo điều kiện thuận lợi cho các Tổ chức, cá nhân làm ăn chân chính nhưng một số ít Tổ chức, cá nhân làm ăn phi pháp đã lợi dụng và đã có hàng ngàn doanh nghiệp thành lập nhưng không có địa điểm kinh doanh hoặc chỉ thành lập 1 thời gian mua hoá đơn sau đó bỏ trốn; lại tiếp tục sang địa phương khác, thành lập doanh nghiệp mới. Từ thực tế này phải có sự giám sát của cơ quan cấp xã, phường; nhằm hạn chế tới mức tối đa việc Tổ chức, cá nhân lợi dụng kẽ hở để thành lập doanh nghiệp chỉ nhằm mục đích là mua, bán hoá đơn và lừa đảo.
Từ năm 1990, theo nghị định 281/HĐBT của Hội đồng bộ trưởng (nay là Chính Phủ) ngành thuế được thành lập theo ngành dọc từ Tổng cục thuế đến các đội thuế phường xã. Đây là thay đổi lớn trong ngành, tuy nhiên phải chịu song trùng lãnh đạo của cấp uỷ và chính quyền địa phương.
Nếu chính quyền địa phương quan tâm đúng mức thì việc thu thuế dễ dàng và ngược lại. Sự lãnh đạo song trùng này đến nay vẫn là hình thức quản lý nhà nước vì thực tế chưa gắn trách nhiệm, quyền lợi của cấp uỷ Đảng và chính quyền địa phương trong việc thu thuế, cân đối thu chi trong ngân sách các cấp, đặc biệt ở các xã, phường có tư tưởng để lại nguồn thu riêng dưới dạng phí, lệ phí. Một số yếu tố tâm lý nữa là: cán bộ chính quyền là do dân bầu ra cho nên một số người sợ không dám đôn đốc kiểm tra, xử lý nghiêm minh theo luật.