1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học

63 23 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Nghiên Cứu Đặc Điểm Phân Tử Trên Gen Apob Và Ldlr Đối Với Bệnh Tăng Cholesterol Máu Có Tính Gia Đình
Tác giả Mai Kim Bảo Châu, Mai Thị Tiền, Phi Lâm Thị Ngọc
Người hướng dẫn ThS. Trương Kim Phượng
Trường học Trường Đại Học Mở Thành Phố Hồ Chí Minh
Chuyên ngành Công Nghệ Sinh Học
Thể loại báo cáo tổng kết đề tài nghiên cứu khoa học sinh viên
Năm xuất bản 2019
Thành phố Bình Dương
Định dạng
Số trang 63
Dung lượng 1,98 MB

Cấu trúc

  • I. TỔNG QUAN (0)
    • I.1. Bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình (FH- Familial hypercholesterolaemia) (15)
      • I.1.1. Tổng quan về bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình (15)
      • I.1.2. Tiêu chí chuẩn đoán bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình (16)
    • I.2. Tổng quan về gen Low Density Lipoprotein Receptor (LDLR) (18)
    • I.3. Gen Apolipoprotein B (APOB) (19)
    • I.4. Một số phương pháp xác định tính chất đột biến điểm trên gen LDLR và gen APOB… (0)
      • I.4.1. Phương pháp PCR kết hợp giải trình tự (PCR - Sequencing) (0)
      • I.4.2. Một số phương pháp khác (0)
  • II. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU (24)
    • II.1. Vật liệu (24)
    • II.2. Phương pháp nghiên cứu (24)
  • III. KẾT QUẢ (28)
    • III.1. Kết quả khai thác dữ liệu và phân tích tổng hợp trên gen APOB (28)
    • III.2. Kết quả thu thập dữ liệu và phân tích tổng hợp gen LDLR (33)
    • III.3. Kết quả khảo sát In silico trên gen APOB (41)
    • III.4. Kết quả khảo sát insilico xác định bộ mồi khuếch đại trình tự gen LDLR (44)
      • III.4.1. Bộ dữ liệu trình tự bộ gen LDLR (44)
      • III.4.2. Bộ mồi khuếch đại trình tự exon 4 gen LDLR (45)
  • IV. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ (0)
    • IV.1. Kết luận (48)
    • IV.2. Đề nghị (0)
  • V. TÀI LIỆU THAM KHẢO (0)

Nội dung

TỔNG QUAN

Bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình (FH- Familial hypercholesterolaemia)

I.1.1 Tổng quan về bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình

Bệnh tăng cholesterol trong máu có tính chất gia đình (Familial Hypercholesterolemia

Bệnh FH (Familial Hypercholesterolemia) là một rối loạn chuyển hóa lipid di truyền, do khiếm khuyết trên các gen mã hóa protein liên quan đến chuyển hóa lipid và cholesterol trong máu (Brown et al., 1986) Bệnh này có hai dạng chính: ADH (Autosomal Dominant Hypercholesterolemia), dạng bệnh lý tăng cholesterol máu tính trạng trội trên nhiễm sắc thể thường, và ARH (Autosomal Recessive Hypercholesterolemia), dạng bệnh lý tăng cholesterol máu tính trạng lặn trên nhiễm sắc thể thường (Taranto et al., 2015).

Bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình (FH) được chia thành hai thể là đồng hợp (HoFH) và dị hợp (HeFH) Trong đó, thể đồng hợp HoFH rất hiếm gặp, với tần suất khoảng 1/1.000.000 trường hợp, trong khi thể dị hợp HeFH có tần suất cao hơn, dao động từ 1/200 đến 1/500 trường hợp (Austin et al., 2004; Nordestgaard et al., 2013; Al-Hinai et al., 2013).

Chẩn đoán bệnh FH là rất quan trọng để phát hiện và điều trị kịp thời, giúp giảm nguy cơ mắc các bệnh lý tim mạch và đột quỵ Tuy nhiên, bệnh FH thường ít được tầm soát Việc chẩn đoán chủ yếu dựa vào kết quả xét nghiệm chỉ số sinh hóa máu, như nồng độ cholesterol HDL-C, LDL-C và cholesterol toàn phần, kết hợp với phân tích tiền sử gia đình, có thể được hỗ trợ bởi xét nghiệm di truyền Bệnh FH được xác định khi giá trị LDL-C vượt quá 190 mg/dL ở người trưởng thành và 160 mg/dL ở trẻ em.

Bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình (FH) là một trong những rối loạn di truyền phổ biến tại Hoa Kỳ, với tỷ lệ khoảng 1 trong 300 người mắc phải Những người có tiền sử gia đình mắc bệnh này có nguy cơ cao hơn, do đó việc nhận diện và quản lý sớm là rất quan trọng để giảm thiểu các biến chứng sức khỏe liên quan.

Cholesterol cao có liên quan đến nguy cơ mắc bệnh tim mạch, đặc biệt là ở những người có khả năng mắc bệnh FH cao hơn (Hopkins et al., 2011) Nguyên nhân gây tăng cholesterol trong máu thường do các yếu tố môi trường, giới tính, tuổi tác và thói quen sinh hoạt không lành mạnh như hút thuốc lá và thiếu vận động (Soutar et al.).

Bệnh tăng cholesterol trong máu có tính chất gia đình dạng ADH chủ yếu do đột biến gen, với khoảng 95% trường hợp liên quan đến gen Low Density Lipoprotein Receptor (LDLR), 2-11% liên quan đến gen Apolipoprotein B (APOB) và 1% trong gen Proprotein Convertase Subtilisin – Kexin type 9 (PCSK9) Khi thụ thể LDL bị khiếm khuyết, cholesterol tích tụ trong huyết tương, dẫn đến xơ vữa động mạch Nồng độ LDL-C cao là hệ quả của việc giải phóng không hiệu quả các hạt LDL do khiếm khuyết trong gen APOB – 100 Sự tích tụ LDL-C trong máu cao làm tăng nguy cơ mắc bệnh động mạch vành gấp 20 lần, với bệnh tăng cholesterol máu thể nặng được xác định khi chỉ số LDL-C vượt quá 190 mg/dL.

I.1.2 Tiêu chí chuẩn đoán bệnh tăng cholesterol máu có tính chất gia đình

According to the World Health Organization (WHO), Familial Hypercholesterolemia (FH) is diagnosed when an adult's cholesterol level is ≥ 5.0 mmol/l Additionally, diagnostic criteria from organizations such as the Dutch Lipid Clinic Network (DLCN), Simon Broome, and the US Make Early Diagnoses Prevent Early Deaths (MEDPED) are commonly utilized for identifying FH patients (Al-Hinai et al., 2013).

Bảng 1.1 Tiêu chí chẩn đoán bệnh FH của tổ chức DLCN

Nhóm 1: Tiểu sử gia đình

Thế hệ thứ nhất có người mắc bệnh tim mạch sớm

Người dưới 55 tuổi ở nam và dưới 69 tuổi ở nữ thuộc thế hệ thứ nhất có nồng độ cholesterol LDL trong máu cao hơn 95% so với các nhóm tuổi và giới tính khác Ngoài ra, thế hệ này còn có dấu hiệu xuất hiện xanthoma ở gân và/hoặc vùng cung giác mạc.

Trẻ em < 18 tuổi có nồng độ cholesterol LDL trong máu cao hơn 95% theo độ tuổi và giới tính 2

Nhóm 2: Tiền sử lâm sàng

Bệnh nhân mắc bệnh tim mạch vành sớm (

Ngày đăng: 12/01/2022, 23:36

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
10. Brown M. S., &amp; Goldstein J. L. (1986). A receptor-mediated pathway for cholesterol homeostasis. Science, 232(4746), pp. 34-47. Norway Sách, tạp chí
Tiêu đề: Science
Tác giả: Brown M. S., &amp; Goldstein J. L
Năm: 1986
11. Chen S. H., Yang C.Y., Chen P. F., Setzer D., Tanimura M., Li W. H. (1986). The complete cDNA and amino acid sequence of human apolipoprotein B-100.Journal of Biological Chemistry, 261(28), pp. 12918-12921. America Sách, tạp chí
Tiêu đề: Journal of Biological Chemistry
Tác giả: Chen S. H., Yang C.Y., Chen P. F., Setzer D., Tanimura M., Li W. H
Năm: 1986
14. Du R., Fan L. L., Lin M. J., He Z. J., Huang H., Chen Y. Q., ... &amp; Xiang R. (2016). Mutation detection in Chinese patients with familial hypercholesterolemia.SpringerPlus, 5(1), 2095 Sách, tạp chí
Tiêu đề: SpringerPlus, 5
Tác giả: Du R., Fan L. L., Lin M. J., He Z. J., Huang H., Chen Y. Q., ... &amp; Xiang R
Năm: 2016
22. Glass G. V. (1976). Primary, secondary, and meta-analysis of research. Educational researcher, 5(10), pp. 3-8 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Educational researcher
Tác giả: Glass G. V
Năm: 1976
24. Hayashi T., Ishikawa T., Naito M., Kuzuya M., Funaki C., Asai K., ... &amp; Kuzuya F. (1991). Low level hyperlipidemia impairs endothelium-dependent relaxation of porcine coronary arteries by two mechanisms. Functional change in endothelium and impairment of endothelium-dependent relaxation by two mediators. Atherosclerosis, 87(1), pp. 23-38 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Atherosclerosis, 87
Tác giả: Hayashi T., Ishikawa T., Naito M., Kuzuya M., Funaki C., Asai K., ... &amp; Kuzuya F
Năm: 1991
26. Higgins J. P., Thompson S. G., Deeks J. J., … &amp; Altman D. G. (2003). Measuring inconsistency in meta-analyses. BMJ: British Medical Journal, 327(7414), p.557 Sách, tạp chí
Tiêu đề: BMJ: British Medical Journal, 327
Tác giả: Higgins J. P., Thompson S. G., Deeks J. J., … &amp; Altman D. G
Năm: 2003
29. Innerarity T. L., Mahley R. W., Weisgraber K. H., Bersot T. P., Krauss R. M., Vega G. L., ... &amp; McCarthy B. J. (1990). Familial defective apolipoprotein B- 100: a mutation of apolipoprotein B that causes hypercholesterolemia. Journal of lipid research, 31(8),pp. 1337-1349 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Journal of lipid research
Tác giả: Innerarity T. L., Mahley R. W., Weisgraber K. H., Bersot T. P., Krauss R. M., Vega G. L., ... &amp; McCarthy B. J
Năm: 1990
30. Innerarity T. L., Young S. G., Poksay K. S., Mahley R. W., Smith R. S., Milne R. W., ... &amp; Weisgraber K. H. (1987). Structural relationship of human apolipoprotein B48 to apolipoprotein B100. The Journal of clinical investigation, 80(6), pp. 1794-1798 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The Journal of clinical investigation
Tác giả: Innerarity T. L., Young S. G., Poksay K. S., Mahley R. W., Smith R. S., Milne R. W., ... &amp; Weisgraber K. H
Năm: 1987
33. Knott T. J., Pease R. J., Powell L. M., Wallis S. C., Rall Jr S. C., Innerarity T. L., ... &amp; Johnson D. (1986). Complete protein sequence and identification of structural domains of human apolipoprotein B. Nature, 323(6090), p. 734 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nature, 323
Tác giả: Knott T. J., Pease R. J., Powell L. M., Wallis S. C., Rall Jr S. C., Innerarity T. L., ... &amp; Johnson D
Năm: 1986
40. Mahdieh N,… &amp; Rabbani B. (2013). An overview of mutation detection methods in genetic disorders. Iranian journal of pediatrics, 23(4), p. 375 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Iranian journal of pediatrics, 23
Tác giả: Mahdieh N,… &amp; Rabbani B
Năm: 2013
43. Nordestgaard B. G., Chapman M. J., Humphries S. E., Ginsberg, H. N., Masana L., Descamps O. S., ... &amp; Wiegman A. (2013). Familial hypercholesterolaemia is underdiagnosed and undertreated in the general population: guidance for clinicians to prevent coronary heart disease: consensus statement of the European Atherosclerosis Society. European heart journal, 34(45), pp. 3478-3490 Sách, tạp chí
Tiêu đề: European heart journal, 34
Tác giả: Nordestgaard B. G., Chapman M. J., Humphries S. E., Ginsberg, H. N., Masana L., Descamps O. S., ... &amp; Wiegman A
Năm: 2013
49. Soria L. F., Ludwig E. H., Clarke H. R., Vega G. L., Grundy S. M., &amp; McCarthy B. J. (1989). Association between a specific apolipoprotein B mutation and familial defective apolipoprotein B-100. Proceedings of the National Academy of Sciences, 86(2), pp. 587-591 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Proceedings of the National Academy of Sciences, 86
Tác giả: Soria L. F., Ludwig E. H., Clarke H. R., Vega G. L., Grundy S. M., &amp; McCarthy B. J
Năm: 1989
50. Soutar A. K., &amp; Naoumova R. P. (2007). Mechanisms of disease: genetic causes of familial hypercholesterolemia. Nature Reviews Cardiology, 4(4), p. 214 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nature Reviews Cardiology, 4
Tác giả: Soutar A. K., &amp; Naoumova R. P
Năm: 2007
51. Truong P. K., Van Bui C., Lao T. D., … &amp; Le T. H. A. (2017, June). Detection of Defective Apolipoprotein B-100 R3500Q Mutation Caused Familial Hypercholesterolemia in Vietnamese Patients. In International Conference on the Development of Biomedical Engineering in Vietnam (pp. 275-279). Springer, Singapore Sách, tạp chí
Tiêu đề: Development of Biomedical Engineering in Vietnam
Tác giả: Truong P. K., Van Bui C., Lao T. D., … &amp; Le T. H. A
Năm: 2017
57. Wiegman A., Gidding S. S., Watts G. F., Chapman M. J., Ginsberg H. N., Cuchel, M., ... &amp; Bruckert, E. (2015). Familial hypercholesterolaemia in children and adolescents: gaining decades of life by optimizing detection and treatment. European heart journal, 36(36), 2425-2437 Sách, tạp chí
Tiêu đề: European heart journal, 36
Tác giả: Wiegman A., Gidding S. S., Watts G. F., Chapman M. J., Ginsberg H. N., Cuchel, M., ... &amp; Bruckert, E
Năm: 2015
13. Di Taranto M. D., D'Agostino M. N., &amp; Fortunato G. (2015). Functional characterization of mutant genes associated with autosomal dominant familial hypercholesterolemia: integration and evolution of genetic diagnosis. Nutrition, Metabolism and Cardiovascular Diseases, 25(11), pp. 979-987 Khác
16. Fan L. L., Lin, M. J., Chen, Y. Q., Huang, H., Peng, D. Q., Xia, K., ... &amp; Xiang, R. (2015). Novel mutations of low-density lipoprotein receptor gene in China patients with familial hypercholesterolemia. Applied biochemistry and biotechnology, 176(1), 101-109 Khác
18. Flores T. D. J. H., García, J. R. G., Fausto, A. G. C., Cárdenas, N. A. V., López, Y. S., Morales, C. A. Z., &amp; Torres, M. T. M. (2018). Screening of LDLR and APOB gene mutations in Mexican patients with homozygous familial hypercholesterolemia. Journal of clinical lipidology Khác
19. Fodde R., &amp; Losekoot M. (1994). Mutation detection by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Human mutation, 3(2), pp. 83-94 Khác
23. Goldstein J. L., Hobbs H. H., &amp; Brown M. S. (1995). Familial hypercholesterolemia: In: Scriver CR, Beaudet AL, Sly WS, Valle D, eds. The Metabolic Basis of Inherited Disease, 8, pp. 2863-2901 Khác

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Bảng 1.1 Tiêu chí chẩn đoán bệnh FH của tổ chức DLCN - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Bảng 1.1 Tiêu chí chẩn đoán bệnh FH của tổ chức DLCN (Trang 17)
Bảng 1.2 Tiêu chí chẩn đoán bệnh FH của Simon Broome - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Bảng 1.2 Tiêu chí chẩn đoán bệnh FH của Simon Broome (Trang 18)
Hình 1.1 Minh họa gen LDLR (Henderson et al., 2016) - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 1.1 Minh họa gen LDLR (Henderson et al., 2016) (Trang 19)
Hình 1.2 Gen APOB định vị trên nhiễm sắc thể 2 (Henderson et al., 2016) - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 1.2 Gen APOB định vị trên nhiễm sắc thể 2 (Henderson et al., 2016) (Trang 20)
Hình 3.1 Sơ đồ quy trình trích xuất dữ liệu trong phân tích tổng hợp tính chất - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.1 Sơ đồ quy trình trích xuất dữ liệu trong phân tích tổng hợp tính chất (Trang 28)
Hình 3.2 Đồ thị “Forest plot” biểu thị tỷ lệ đột biến gen APOB trên bộ mẫu - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.2 Đồ thị “Forest plot” biểu thị tỷ lệ đột biến gen APOB trên bộ mẫu (Trang 30)
Hình 3.3 Đồ thị “Funnel plot” đánh giá tính bất đồng nhất của bộ dữ liệu đoàn - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.3 Đồ thị “Funnel plot” đánh giá tính bất đồng nhất của bộ dữ liệu đoàn (Trang 31)
Hình 3.4 Sơ đồ quy trình trích xuất dữ liệu trong phân tích tổng hợp tính chất - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.4 Sơ đồ quy trình trích xuất dữ liệu trong phân tích tổng hợp tính chất (Trang 34)
Hình 3.5 Đồ thị “Forest plot” biểu thị tỷ lệ đột biến gen LDLR trên bộ mẫu - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.5 Đồ thị “Forest plot” biểu thị tỷ lệ đột biến gen LDLR trên bộ mẫu (Trang 36)
Hình 3.6 Đồ thị “Funnel plot” đánh giá tính bất đồng nhất của bộ dữ liệu đoàn - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.6 Đồ thị “Funnel plot” đánh giá tính bất đồng nhất của bộ dữ liệu đoàn (Trang 37)
Hình  PH  I 2  (%)  Tổng cộng  30  51,2(41,214-61,201)  R  &lt; 0,0001  98,31% - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
nh PH I 2 (%) Tổng cộng 30 51,2(41,214-61,201) R &lt; 0,0001 98,31% (Trang 39)
Bảng 3.5 Kết quả phân tích tính chất đột biến một số exon gen LDLR - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Bảng 3.5 Kết quả phân tích tính chất đột biến một số exon gen LDLR (Trang 40)
Hình 3.7 Đồ thị “Forest plot” phản ánh tỷ lệ đột biến trên exon 4 - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Hình 3.7 Đồ thị “Forest plot” phản ánh tỷ lệ đột biến trên exon 4 (Trang 41)
Bảng 3.7 Thông số vật lí một số bộ mồi khuếch đại exon 26 thuộc gen APOB - Nghiên cứu đặc điểm phân tử trên gen apob và ldlr đối với bệnh tăng cholesterol máu có tính gia đình nghiên cứu khoa học
Bảng 3.7 Thông số vật lí một số bộ mồi khuếch đại exon 26 thuộc gen APOB (Trang 42)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w