August 13, Khai thác các đặc tính sinh học của plasmid, ngày nay plasmid được ứng dụng một cách rộng rãi trong công nghệ sinh học và di truyền.. PHÂN LOẠI PLASMID - Một cách để phân
Trang 1TRƯỜNG ĐH SP TP.HCM
KHOA SINH HỌC
SINH 2B-K34
GVHD : Trần Thanh Thủy
SVTH : Lê Hoàng Thái Vinh
Ngô Thị Thanh Trân
Trang 2II.1. Plasmid vi khuẩn
II 2. Ứng dụng của plasmid trong công nghệ
sinh học
III KẾT LUẬN
IV TÀI LiỆU THAM KHẢO
Trang 3Xét về mặt chuyển giao gen trong môi
trường, plasmid là những phương tiện
hết sức linh hoạt vận chuyển ADN từ
cá thể này sang cá thể khác.
Trang 4August 13,
Khai thác các đặc tính sinh học của
plasmid, ngày nay plasmid được ứng
dụng một cách rộng rãi trong công
nghệ sinh học và di truyền.
Các plasmid của vi khuẩn: pSC101 (trái), plasmid siêu xoắn
Trang 5Ở vi khuẩn và một số nấm men, ngoài các gen
nằm trong genophore còn có các yếu tố di
truyền ngoài thể nhiễm sắc, gọi là plasmid.
Plasmid là phân tử DNA có kích thước nhỏ 5kb), dạng vòng, nằm độc lập trong tế bào
(2-chất, có khả năng sao chép độc lập, không phụ thuộc vào sự sao chép DNA nhiễm sắc thể của vi khuẩn
Trang 6August 13,
- Mỗi tế bào vi khuẩn có khoảng 20 plasmid
- Plasmid gồm 8000 ─ 200.000 cặp nucleotit
- Các Plasmid không phải là các yếu tố nhất thiết phải có đối với sự sống của tế bào,
nhưng khi có mặt , chúng đem lại cho tế
bào nhiều đặc tính chọn lọc quý giá như
chống chịu với nhiệt độ bất lợi, thuốc màu , kháng sinh , các chất dinh dưỡng …
Trang 7August 13,
Plasmid có ở rất nhiều loài vi khuẩn: E.coli
và ở nhiều loài trực khuẩn đường ruột và
vi khuẩn Gram âm (RP1, RSF 1030…), ở
tụ cầu khuẩn vàng St.aureus (pT127,
pC194…), ở xạ khuẩn Streptomyces
coelicolor (pSLPI…), ở Rhizobium melitoli
(pSymA, pSymB) v.v…
Trang 8August 13,
Sơ đồ minh họa một tế bào vi khuẩn với plasmid ở bên trong
(2) Plasmids
(1) DNA nhiễm sắc thể
Trang 9August 13,
2 HÌNH DẠNG PLASMID
Trang 10August 13,
(4) Phần đặc hiệu
Trang 11August 13,
4 PHÂN LOẠI PLASMID
- Một cách để phân nhóm các plasmid là
dựa vào khả năng truyền sang vi khuẩn
khác của chúng:
+ Plasmid tiếp hợp (conjugative) chứa các
tra-genes , giúp thực hiện một quá trình
phức tạp gọi là tiếp hợp (conjugation),
chuyển một plasmid sang vi khuẩn khác
Trang 12August 13,
PLASMID TiẾP HỢP
Trang 13August 13,
PHÂN LOẠI PLASMID
+ Plasmid không tiếp hợp là những plasmid
không có khả năng tự thực hiện tiếp hợp.
+ Còn có một nhóm plasmid trung gian gọi là
nhóm di chuyển được (mobilisable) Chúng chỉ mang các gene cần thiết cho việc di chuyển.
+ Các plasmid còn lại được xếp vào các nhóm
không tương hợp (incompatibility group), dựa
vào khả năng cùng tồn tại của chúng trong một
tế bào
Trang 14August 13,
Một cách khác để phân loại plasmid
là dựa vào chức năng Có 5 nhóm
chính:
+ Plasmid giới tính (Fertility-(F) plasmid),
mang các tra - gene , có khả năng tiếp
Trang 16August 13,
Sơ đồ tiếp hợp plasmid mang tính
kháng
Gen kháng kháng sinh
Trang 17August 13,
+ Col-plasmid , chứa gene mã hóa cho sự tổng hợp colchicine , một protein có thể giết chết các vi khuẩn khác.
như toluene hay salicylic acid
+ Plasmid mang độc tính , làm cho sinh vật trở thành sinh vật gây bệnh.
Trang 18August 13,
5 Sự nhân lên của plasmid:
- Khi tế bào phân chia , plasmid có khả năng tự nhân lên 1-2 bản sao (đối với plasmid lớn)
hoặc vài chục đến vài trăm bản sao (đối với plasmid bé)
- Sự nhân lên của plasmid cũng xảy ra rất
nhanh , trong vòng vài chục phút , đúng như thời gian trực phân của một tế bào vi khuẩn.
- Ví dụ như vi khuẩn E coli chẳng hạn, cứ
khoảng 20 phút là có một chu kì phân chia
Trang 19August 13,
5.1 Sự nhân lên của plasmid không tiếp hợp (plasmid ColE1)
Trang 20August 13,
Plasmid tiếp hợp khác với plasmid không
tiếp hợp ở số lượng tồn tại trong một tế
bào Mỗi một tế bào vi khuẩn chủ chỉ có
1-2 plasmid F.
Chúng còn khác ở chỗ, plasmid F có khả
năng tạo ra ít nhất là một loại sản phẩm
protein cần thiết để tham gia vào quá trình nhân lên
5.2 Sự nhân lên của plasmid tiếp
hợp (plasmid F)
Trang 21August 13,
Trang 22August 13,
6 Phân biệt DNA nhiễm sắc thể
với DNA của plasmid:
DNA nhiễm sắc thể DNA plasmid
• Nằm trong nhân tế bào.
• Dạng chuỗi dài, xoắn
kép
Trong ……… của vi khuẩn
tế bào chất
vòng
Nu ít
làm thể truyền
Trang 23August 13,
II.2 ỨNG DỤNG CỦA PLASMID TRONG CÔNG NGHỆ SINH HỌC
Trong công nghệ sinh học, người ta sử dụng
plasmid làm vectơ để chuyển ghép gen từ tế bào cho sang tế bào nhận, từ đó nhân dòng
tạo ngân hàng genophore hoặc cho gen biểu hiện thu sản phẩm protein có hoạt tính sinh học
Các Plasmid luôn được cải biến để ngày càng thuận tiện hơn qua nhiều thế hệ, thuận tiện cho công nghệ ADN tái tổ hợp
Trang 24August 13,
1 VECTOR
- Vector mang các đặc điểm sau:
+ Có điểm khởi sự sao chép (ori ) để tự sao chép
mà tồn tài độc lập trong tế bào.
+ Có các đoạn trình tự nhận biết cho enzym giới hạn cắt rồi để hở tạo nơi lắp ráp các đoạn gen
lạ
+ Có đoạn trình tự khởi điểm (promoter).
+ Chứa các gen vô hiệu hóa các đoạn DNA không mong muốn khi bị gắn nhầm.
+ Có khả năng tự tạo nhiều bản sao
Trang 25August 13,
pBR322 - một vector tạo dòng được dùng trong DNA sequencing
- với vị trí của khởi điểm tái bản (ori), các gene kháng AmpR và TetR và một số vị trí của các enzyme cắt giới hạn.
Trang 26August 13,
2 Các công đoạn trong kỹ thuật tái tổ hợp ADN
Bước 1: Nuôi tế bào cho plasmid để tạo vector
chuyển gen và nuôi tế bào cho để cung cấp DNA
Bước 2: Tách chiết DNA plasmid và DNA tế
bào cho, còn gọi là bước phân lập
Bước 3: Cắt cả 2 lọai DNA (DNA plasmid và
DNA tế bào cho) bằng cùng loại enzym giới hạn
Trang 27August 13,
Bước 4: Trộn chung DNA plasmid đã bị cắt với DNA tế bào cho cũng đã bị cắt
Bước 5: Bổ sung enzym nối ligase để tạo ra
DNA tái tổ hợp hoàn chỉnh
Bước 6: Biến nạp DNA tái tổ hợp vào tế bào
chủ và nhân dòng
Bước 7: Chọn lọc và tạo dòng tế bào chủ
mang DNA tái tổ hợp và theo dõi hoạt động
Biểu hiện của gen thông qua sản phẩm của gen lấy từ tế bào cho
Trang 28August 13,
3 ADN tái tổ hợp được sử dụng rất rộng rãi trong nhiều lĩnh vực như:
- Nhân dòng ADN tái tổ hợp.
- Chuyển gen động vật.
- Chuyển gen thực vật.
- Sản xuất insulin
- Sản xuất vaxsine….
Trang 29Enzim cắt
Tách ADNnst
tb cho
Tách plasmit
Trang 30August 13,
Clip về nhân dòng tạo ngân hàng gen
Trang 31August 13,
TẠO NGÂN HÀNG GEN
Trang 32August 13,
SẢN XUẤT INSULIN
Trang 33August 13,
SẢN XUẤT VẮC XIN ĐƯA VÀO CÁ
Trang 34August 13,
CHUYỂN GEN THỰC VẬT
Trang 35August 13,
ĐƯA GEN VÀO DÊ ĐỂ SẢN XUẤT SỮA NGƯỜI
Trang 36August 13,
III KẾT LUẬN
- Plasmid đóng một vai trò quan trọng
trong các phòng thí nghiệm di truyền
và sinh hóa , nơi chúng được sử dụng
để nhân bản hoặc biểu hiện các gene
cần quan tâm
- Có rất nhiều plasmid được thương mại hóa cho các ứng dụng trên.
Trang 37August 13,
- Sự phát hiện plasmid vi khuẩn và tạo ra các sản phẩm từ plasmid đã giúp con người tìm
ra các hướng đi mới, các sản phẩm mới
trong y học cũng như trong nông nghiệp
- Từ đó nâng cao sức khỏe con người, cải
thiện năng suất và chất lượng giống cây
trồng, vật nuôi…
- Cần tìm hiểu và tạo ra nhiều sản phẩm sinh học có lợi từ plasmid hơn nữa
Trang 38August 13,
Trang 40August 13,
IV TÀI LiỆU THAM KHẢO
1, GS TS Nguyễn Thành Đạt, 2007 “ Cơ sở
sinh học vi sinh vật – tập 1” NXB Đại học Sư phạm
2, TS Trịnh Đình Đạt, 2007 “ Công nghệ sinh học – tập 4 – Công nghệ di truyền” NXB
Giáo dục.
3, http://www.hcmbiotech.com.vn/
new_news_dhetail.php?cateid=11&id=810
4, http://vi.wikipedia.org/wiki/Plasmid
Trang 41August 13,
Trang 42August 13,
Trang 43August 13,
1, Tại sao trong môi trường nuôi cấy là
Ampicillin thì các vk E.coli khong có plasmid tái tổ hợp lại bị chết?_Đặng Văn Danh
Trong đoạn phim:
Vì plasmid có mang gen kháng Ampicillin nên
khi nuôi dưỡng trong Ampicillin:
+ Những VK E.Coli nào có chứa plasmid thì mới
có thể kháng được Ampicillin nên nó sẽ sống
+ Còn những VK không chứa plasmid thì không kháng được Ampicillin nên nó sẽ chết
Trang 44August 13,
2 Tinh sạch plasmid bằng cách nào?_
Nguyễn Thị Thơm
Tinh sạch plasmid hay tách plasmid ra khỏi
VK.
Hiện tại, có 3 phương pháp chính :
- Pháp thuỷ phân bằng kiềm (alkaline lysis):
Vi khuẩn bị dung giải (lysis) khi xử lý với
dung dịch chứa SDS (sodium dodecyl
sulfate) and NaOH
Trang 45August 13,
chứa DNA plasmid được phá vỡ bằng
lysozyme, Triton-X100 (một chất tẩy phi ion – nonionic detergent) và nhiệt độ
- Phương pháp dùng Lithium: khi xử lý với hỗn hợp Triton X-100/LiCl thì chỉ có màng trong
(inner plasma membrane) của tế bào vi
khuẩn sẽ bị phân huỷ
Trang 46August 13,
3 Hiện tại đã có cá lai với thực vật bằng
công nghệ DNA tái tổ hợp hay chưa?_Đặng Văn Danh
- Hiện tại thì chưa có cá lai với thực vật bằng công nghệ DNA tái tổ hợp
Trang 47August 13,
4 Đa số plasmid là có lợi hay còn có hại?
- Ngay câu hỏi của bạn đã có câu trả lời Đa số chứ không phải tất cả
- Đúng như vậy, bên cạnh những plasmid có lợi vẫn có một số plasmid có hại
Ví dụ: có các loại plasmid sản xuất men phân hủy 2,4-D (2,4-diphenoxyacetic acid), một
loại chất cực kì độc hại và nhiều hợp chất
gây độc khác
Trang 48August 13,
5 Các chất có khả năng ngăn cản sự
nhân lên của DNA plasmid?
Một số hoạt chất hoặc dược chất có khả năng ngăn cản ADN của plasmid nhân lên Các chất này
được gọi là các tác nhân diệt trừ
Ví dụ, chất acridin orange can thiệp vào sự nhân
lên của loại plasmid F
- Một dược chất khác, mitomycin-C, có tác dụng ngăn cản sự nhân lên của ADN của tế bào nói
chung, và do vậy đây cũng là một tác nhân diệt trừ hữu hiệu đối với ADN của plasmid, đặc biệt là plasmid của vi khuẩn Pseudomonas
Trang 49August 13,
6 Những ứng dụng của công nghệ plasmid trong việc chữa bệnh cho người?
- Sản xuất vacxin chữa bệnh cho người
- Sản xuất kháng sinh cho cả người và động vật
Trang 50August 13,
7 Theo bạn có nên chuyển gen vào thực
vật để tạo ra các cây mới? Khi chuyển gen vào thực vật có xảy ra những đột biến gì
cho người sử dụng không?
- Theo như các nhà khoa học đã chứng minh
và kiểm chứng thì vẫn chuyển gen vào thực vật để tạo ra cây mới
+ Vì theo kiểm chứng của các nhà khoa học:
vật chuyển gen biểu hiện ra ngoài thì kết quả thu được là nó không biểu hiện
Trang 51August 13,
- Nhưng các nhà khoa học cũng khuyến cáo là
không nên sử dụng nhiều nguồn gen mới
thay thế cho nguồn gen hiện tại Vì khi đó
không chừng chất độc có thể biểu hiện ra
ngoài và gây ra bệnh
Trang 52August 13,